该如何设置研发支出辅助账的问题：

建立研究开发费用明细账，正确核算研究开发费是申请认定高新技术企业的最基本要求，实际工作中争论的焦点是如何按研发项目建立研究开发费用明细账问题，是在财务会计账套中直接按研发项目建立明细账进行核算（较为复杂，工作量相对大一些），还是在财务会计账套之外建立辅助账进行核算（比较简单，工作量相对小一些），记账报税这一块应当落实到位，而且各地科技部门和中介机构认识都不一致，根据《工作指引》规定，“企业应按照《企业年度研究开发费用结构明细表》设置高新技术企业认定专用研究开发费用辅助核算账目，提供相关凭证及明细表，并按本《工作指引》要求进行核算”。

《国家税务总局公告2015年第97号》第五条核算要求规定，企业应按照国家财务会计制度要求，对研发支出进行会计处理。研发项目立项时应设置研发支出辅助账，由企业留存备查，年末汇总分析填报研发支出辅助账汇总表。研发支出辅助账、研发支出辅助账汇总表可参照本公告所附样式编制。

因此，《工作指引》和《国家税务总局公告2015年第97号》都只要求设置研发支出辅助账，没有明确要求必须在财务会计账套中直接设置辅助账。以上便是设置研发支出辅助账问题的解决方法，希望对您有所帮助。